Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNB1P01574 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNB1P01574 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNB1P01574 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms