Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSP01100 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSP01100 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSP01100 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSP01100 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSP01100 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOSP01100 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSP01100 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSP01100 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms