Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD1O95696 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD1O95696 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD1O95696 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD1O95696 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD1O95696 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD1O95696 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms