Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBOX1O75936 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms