Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNSO60931 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNSO60931 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNSO60931 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNSO60931 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNSO60931 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNSO60931 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNSO60931 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNSO60931 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNSO60931 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNSO60931 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNSO60931 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms