Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSVO60911 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSVO60911 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSVO60911 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSVO60911 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSVO60911 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSVO60911 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSVO60911 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSVO60911 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSVO60911 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTSVO60911 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms