Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP104O60308 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP104O60308 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP104O60308 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP104O60308 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms