Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB2O43741 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms