Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms