Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ2O43526 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms