Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms