Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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