Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB6O15197 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms