Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms