Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR3AO14802 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR3AO14802 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3AO14802 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3AO14802 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3AO14802 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3AO14802 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3AO14802 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms