Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX7O00628 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX7O00628 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms