Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLIM4O00461 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms