Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms