Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF10AO00220 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms