Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3KT08 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3KT08 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3KT08 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3KT08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms