Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B2RBV5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B2RBV5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
B2RBV5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
B2RBV5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
B2RBV5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B2RBV5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B2RBV5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B2RBV5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B2RBV5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B2RBV5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms