Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOBPA7XYQ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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