Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms