Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC169A6NNP5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms