Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms