Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00862A6NCI5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms