Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM221AA4D161 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM221AA4D161 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms