Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX2A2RU54 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms