Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX20

TRBV7-6, T-cell receptor beta variable 7-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-6A0A0J9YX20 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-6A0A0J9YX20 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV7-6A0A0J9YX20 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV7-6A0A0J9YX20 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-6A0A0J9YX20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV7-6A0A0J9YX20 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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