Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MLXIPL-211ENST00000488212 534 ntTSL 210.59□□□□□ -0.716e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MMS19-212ENST00000444411 640 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 BCAR1-216ENST00000564170 552 ntTSL 420.91■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ATP11B-202ENST00000466758 2390 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.355e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 414.52□□□□□ -0.094e-14■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 223.73■■□□□ 1.391e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 223.38■■□□□ 1.331e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 320.13■□□□□ 0.811e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-204ENST00000553343 681 ntTSL 220.11■□□□□ 0.811e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 219.08■□□□□ 0.651e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.61e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 318.28■□□□□ 0.521e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-219ENST00000556523 735 ntTSL 316.37■□□□□ 0.211e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 314.99□□□□□ -0.011e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SDR39U1-214ENST00000555778 608 ntTSL 212.96□□□□□ -0.331e-24■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.337e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.367e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PEX13-205ENST00000472678 601 ntTSL 212.22□□□□□ -0.457e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.287e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SMAD3-205ENST00000558428 554 ntTSL 411.94□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SMAD3-208ENST00000558827 552 ntTSL 411.86□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SLC39A14-207ENST00000518348 1086 ntTSL 210.88□□□□□ -0.679e-17■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 HGFAC-203ENST00000509689 1894 ntTSL 520.85■□□□□ 0.932e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 FASN-212ENST00000637525 141 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-21■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOL11-207ENST00000581966 476 ntTSL 510.61□□□□□ -0.713e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOL11-211ENST00000584942 552 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOL11-205ENST00000581106 584 ntTSL 38.65□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 27.98□□□□□ -1.133e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 LINC01089-206ENST00000537157 479 ntTSL 221.92■■□□□ 1.12e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 521.57■■□□□ 1.042e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SSFA2-215ENST00000495248 219 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SSFA2-210ENST00000470129 269 ntTSL 31.83□□□□□ -2.122e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SRGAP2-214ENST00000605476 2484 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.745e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUDT4-207ENST00000550056 531 ntTSL 415.54■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUDT4-203ENST00000546925 569 ntTSL 411.52□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 510.6□□□□□ -0.718e-12■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.946e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 EMC10-207ENST00000599293 1926 ntTSL 326.01■■□□□ 1.756e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.516e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 EMC10-208ENST00000601780 2178 ntTSL 1 (best)23.11■■□□□ 1.296e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.16e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PHKB-213ENST00000567200 412 ntTSL 311.24□□□□□ -0.616e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 220.73■□□□□ 0.915e-14■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 216.07■□□□□ 0.165e-14■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.312e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-10■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.84□□□□□ -0.351e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.361e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MS4A3-204ENST00000525686 746 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 58.31□□□□□ -1.081e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GLO1-202ENST00000470973 1939 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.141e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.87□□□□□ -1.311e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 AC116366.3-204ENST00000638504 7262 ntAPPRIS P5 TSL 56.84□□□□□ -1.311e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GRAP2-203ENST00000420971 568 ntTSL 26.63□□□□□ -1.351e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.08□□□□□ -1.441e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46□□□□□ -1.451e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 55.47□□□□□ -1.531e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.621e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.641e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.072e-25■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PPP1R7-210ENST00000427172 421 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PPP1R7-213ENST00000450367 1030 ntTSL 510.44□□□□□ -0.745e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZNF251-204ENST00000530353 2342 ntTSL 223.93■■□□□ 1.425e-11■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 516.04■□□□□ 0.165e-11■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.025e-11■□□□□ 11
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