Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1Q9Y6S9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms