Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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