Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAD1L1Q9Y6D9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAD1L1Q9Y6D9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms