Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX10Q9Y5X0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms