Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL11Q9Y3B7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms