Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX24Q9Y343 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms