Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX2Q9Y2T7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX2Q9Y2T7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms