Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms