Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms