Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHTF1Q9UMS5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms