Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FZD4Q9ULV1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FZD4Q9ULV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms