Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRPC5Q9UL62 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC5Q9UL62 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC5Q9UL62 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms