Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SARDHQ9UL12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms