Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms