Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms