Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN8Q9UBY8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms