Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms