Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms