Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRNQ9P2B2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms