Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM5Q9P217 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM5Q9P217 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM5Q9P217 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM5Q9P217 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSWIM5Q9P217 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSWIM5Q9P217 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSWIM5Q9P217 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms